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那其实是两道杠，不是等号，也不是有些回答中提到的“Z”和“2”，而且那两道杠很可能是分两次划上去的。总分下面划两道杠很可能是之前纸质阅卷时代“合分”与“复核”遗留下来的习惯。

简单地说，第一次合出来的总分下划一杠表示总分，复核后再划一杠表示已经复核。

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在实行网上阅卷之前，中小学大型考试（特别是升学考试和毕业年级的模拟考试）的试卷的主观题部分都是约30份一本，密封装订在一起的。而客观题是通过答题卡上机阅卷的。

二卷中主观题每个题目前面会有题号和得分框，二卷卷首也会有带着题号的空白表格（表格的情况可以参看楼下"初阳"提供的回答中的图片）。批改一般是按题目分工，即某部分老师专门负责批改某一道试题——这样有利于统一评分标准。批改之后，要将单题得分填在题目前的得分框中（有时为了省事也可能直接写在题干或解答上），同时也应该填写在卷首的表格中（有时为了省事也会不填）。
全部试题改完之后，题头和卷首的表格中就会有多个题目的单题得分，接下来就是“合分”。合并出来的总分，一般是填写在卷首的空白处，而不是写在表格中，因为表格往往空会太小。为了防止总分和单题得分混淆，合分后总分下面要划一道杠——这是有必要的，因为有些较低的个位数总分有可能和单题的得分相当。如果试卷上没有印制得分框，这一道杠就会更加必要。

合分之后还要有人另行复核一遍，防止出错，这叫“复核”（也叫“核分”），“复核”就是重复“合分”的工作，如果有错误则改正过来；没有错误，就在总分下再划第二道杠，表示总分复核过了。“复核”也是很有必要的，原来教书时参与阅卷的时候，偶尔总会找出之前的合分错误。

你可能觉得这样做有些小题大做了，但上面说的可是大型考试，一分的高低也可能左右学生的前途，严谨、规范的操作流程当然是十分必要的。

至于平时的小考，因为历次大型考试发回来的试卷都是总分下面两道杠，估计慢慢地老师也就习惯了，即使没有上面复杂阅卷流程的小考，老师也习惯在总分下划两道杠了。一代师生，又一代师生的往下流传。
因为老师习惯的不同，总分数下面这两道杠有时候会等长（看起来像等号），有时候不等长；有时候会变成一道杠，有时候也可能没有杠。当然，最常见的还是两道杠。有时候老师自己连续划两道杠的时候，也可能连笔成像是“Z”或“2”的形状。
所以我认为两道杠是纸质阅卷时代“合分”与“复核”遗留下来的习惯，说白了就是表示总分和复核过的分数。至于其他回答中指出的“醒目”、“快感”、“节奏感”，也有道理，但不是主因。其他回答和评论中，有人认为是防止学生篡改分数，有人认为两道杠是寓意“托”住学生的成绩不要下降，各种欢乐，大家可以翻翻看。

其实这个问题挺有意思的，但绝大部分师生都熟视无睹，之前我也问过一些教师同行，也大都没思考过，临时考虑也大多答不上来。但抛出以上答案之后，大部分同行是认同的
本人只做过十年高中教师，只参加过有限次的阅卷，以上答案只是我自己的思考。
另外，现在很多大型考试都改为网上阅卷了，师生们能了解上述阅卷流程的机会就更少了。
补充：
谭大宇提供的新回答说是“以前会计都是手工做账，账簿的合计数，累计数，下面是要划双杠的。”理论上说，这也是可能的一种合理解释。但如果能说清为什么老师阅卷时会尊重普通人并不熟悉的会计习惯，会更有说服力。
目前我仍然比较强烈地倾向于上述我自己的解释，而且觉得老师划双杠与会计划双杠这两件事有共通之处，也许是有些朋友评论中所说的“表示合计”，也许有方家能出来说清两者之间更深层次的联系。